प्रीज़न ब्रेक की कहानी दो भाइयों, माइकल स्कॉफील्ड (वेन्टवर्थ मिलर) और लिंकन बर्ब्स (डोमिनिक पुरसेल) के बारे में है। माइकल एक इंजीनियर है जो अपने भाई लिंकन को बचाने के लिए जेल में जाता है, जिसे एक अपराध के लिए गिरफ्तार किया गया है जो उसने नहीं किया था।