Un incidente inesperado ocurre cuando los nuevos pilotos detectan un convoy enemigo en el Pacífico, liderado por una nave de combate retroequipada con armas nucleares. Maverick y Goose Jr. deben pilotar una manada de jets para interceptarlos. Durante la persecución, un caos erupta cuando un terremoto colapsa la torre de control de Miramar, y su única vía de comunicación es una radio de emergencia que pertenece a un antiguo enemigo —el piloto que una vez destruyó a Goose en la Guerra del Golfo.